《塞尔达传说》系列一直都是任天堂的看家作品,而《塞尔达传说:灵魂轨迹》作为该系列继《幻影沙漏》的第二部作品,继承了前作许多的优良传统:操作方式,在地图上写写画画,还有冒险需要的佳通工具。同时,《灵魂轨迹》也进一步发展了前作中的许多试水要素,当然,此次的故事仍然发生在海拉尔大陆,玩家将扮演列车长林克,开着火车穿行于世界各地,利用铠甲塞尔达公主的力量进行解谜。
航海时代已经结束,人类早已定居在了新大陆之上;这片大陆是由灵魂一族洛克莫族人守护的,有着发达的火车文化,灵魂的铁轨四通八达。海拉尔王室就在这片大陆休养生息,勇者的血脉也得到繁衍。然而和平注定不会长久,王室公主的保姆科尔(Cole)竟是这片大陆远古恶魔的仆从,密谋策划让魔王玛拉多斯(Malladus)复活。为此他夺走了塞尔达公主的身体,破坏了灵魂之塔,整片大陆上的铁轨也陆续消失。而塞尔达公主的灵魂幸免于这场劫难,并和我们的主人公林克一起,展开了修复大陆铁轨,夺回自己身体的有趣冒险。
火车系统:和前作《风杖》,《沙漏》不同,林克并不是在海洋上航行,在岛屿上冒险,而是变成了在铁轨上乘火车,在经停的一个个车站冒险,这也是是系列中第一次出现火车这一交通工具。
火车部件系统:在本作游戏中,林克会在冒险中得到一些宝物,用这些宝物可以兑换新的火车部件,使收集火车部件多了目的性。
乐器演奏:在游戏中林克可以演奏名为灵魂排箫(Spirit Flute)的乐器,通过演奏特定曲目来达到解谜的目的。
双人解谜:在本作中,林克可以靠攻击幻影骑士来让塞尔达的灵魂融入,从而同时操纵林克和幻影骑士。《轨迹》把它提升到了游戏主线解谜的部分,设计了一些精彩纷呈的双人谜题。
隐藏车站挑战:《轨迹》的地图上存在一些靠解锁新铁轨能到达的隐藏车站。这些车站一般都藏着珍贵的收集宝物,不过它们都需要林克解开一些谜题才能到达。
Boss Rush挑战:该游戏分为三个等级,允许林克挑战一群又一群的敌人,不仅如此,这个游戏还可以让林克反复挑战迷宫中出现的boss们,给游戏增加了重复游玩的可能性。