UCSF Chimera是一款完全免费的分子模拟仿真软件,用以分子结构和有关数据信息的互动大数据可视化,分析数据包含相对密度图,超分子组成,排列顺序,连接結果等,能够形成图象和动漫。
1、出示了一组有效的特点和清楚的页面。
2、在第一次起动应用软件时,你能碰到一个基本上太简易的主对话框,它只不过一个数据可视化控制面板和一个紧凑型的工具栏,不象一般应用普遍菜单栏的别的分子分析工具。
3、因而,UCSF嵌合体放弃了一点应用性,便于为分子剖析出示一种无影响的自然环境。它还有一个巨大的文本文档一部分,你应该花一些時间来阅读文章,因为它能够协助你减少学习时间的一半。
4、附加了一套普遍的数据可视化和分析工具
5当提到特点时,公共事业出示的物品比你想像的要多。最先,你应该知道它能够造成高品质的图象和动漫。它还附加了一个编码序列查看器,它事实上使您能够搜索、查询和编写序列比对。
6、沒有太过繁杂的事儿,应当提及的专用工具来适用互动式黑影,形变,Ramachandran图和工程爆破蛋白质。
7、分子剖析的强有力专用工具
8、您还应当了解UCSF Cimeta使您可以更改情况,即您能够将图型对话框更改成单独颜色、好几个颜色的竖直渐变色,乃至从电子计算机载入图象。
9、该常用工具含有一个流线形的页面,一个巨大的文本文档,实例教程和事例,能够协助你立刻刚开始。道德底线,UCSF嵌合体是一个强劲的运用分子剖析,包裝很多有效的特性,而不觉得担心。
1、强劲的轴、平面图和质心作用,轴能够表明为圆柱,平面图表明为圆轮,质心表明为圆球,这种都能够用以间距和角度测量仪。
2、容积数据信息:能够显示三维电子器件和显微镜数据信息、x放射线相对密度图、静电势和别的容积数据信息。
3、b因素上色:能够对结构上色以显示特性值
4、挑选分子连接
5、根据维护上色
6、卷平面图显示
7、转动同分异构体
1、根据点一下或双击鼠标嵌合体标志(在于它的部位)来起动嵌合体。一般,这一标志将出現在桌面。Cimela可执行程序还可以从其安裝部位运作。
2、将出現一个溅出显示屏,在几秒内由包括图型显示或最近使用的文档的快速访问目录的主嵌合体对话框更换(这并不重要,由于开启一个结构将全自动将显示器转换到图型对话框)。假如你喜爱,根据点一下并拖拽右下方来变大对话框。对话框还可以根据点一下它的顶端栏和拖拽来挪动。
3、开启结构
4、如今开启一个结构。从菜单中选择文档ID ID获得,并将1ZIK做为结构的ID从PDB中取下。该结构将出現在图型对话框中,它是由2个肽产生的亮氨酸拉锁。
5、默认设置的原始显示是打印色带。也显示原子:
6、这显示了结构中的全部原子和键,除开肽链中的这些被彩带显示抑止。下边探讨怎样显示用以显示、上色等结构的特殊一部分。最开始,杂原子(碳之外的原子)由元素组成:氧原子、氮原子、深蓝色等。碳维持实体模型颜色,在这类状况下是深褐色。
7、掩藏绸带,外露框架原子,随后再度展现绸带
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